58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4837 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  65.1 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  67.36 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  61.76 
 
 		 148 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  58.7 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  58.7 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  58.09 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  53.33 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  60.14 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  47.15 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  46.72 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  39.71 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  39.66 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  37.93 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  33.06 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  34.17 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  32.54 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  32.54 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  29.63 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  34.88 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  33.59 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  31.54 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  37.8 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  29.41 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  30.65 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  31.75 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  31.75 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  32.5 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  29.06 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  27.2 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  29.33 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  32.18 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  28.81 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  29.27 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  28.24 
 
 		 638 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>