36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4057 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  60.77 
 
 
131 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  60.77 
 
 
131 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  60.63 
 
 
128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  46.03 
 
 
128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  38.71 
 
 
150 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  36.23 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  33.04 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  35.38 
 
 
638 aa  70.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  34.82 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  31.71 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  31.85 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  32.23 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  31.36 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  30.58 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  32.31 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  28.91 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  31.78 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  29.57 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  26.79 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  28.06 
 
 
223 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0483  hypothetical protein  27.78 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  26.13 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  30.7 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  27.43 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  27.43 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  28.7 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3427  hypothetical protein  26.4 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  25.64 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  25.47 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  27.43 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  26.55 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>