42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2136 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  45 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  40.6 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  37.76 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  36.11 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  36.3 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  35.54 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  41.8 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  35.54 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  35.38 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  33.59 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  34.45 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  34.45 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  32.79 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  27.12 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  27.12 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  33.33 
 
 		 638 aa  61.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  35.34 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  30.95 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  28.32 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  28.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0483  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  23.08 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  30.47 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  24.24 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  26.05 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2163  hypothetical protein  32.29 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  31.19 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>