35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3239 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  37.8 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  37.8 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  41.13 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  34.68 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  38.73 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  36.15 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  40.16 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  37.01 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  33.81 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  36.97 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  30.66 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  31.88 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  35.25 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  35.66 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  31.06 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  32.09 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  31.34 
 
 		 638 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  32 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  29.03 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  28.07 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  29.06 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  24.78 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  27.69 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  27.69 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  29.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30869  predicted protein  27.34 
 
 		 353 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.439697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  29.57 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  30.36 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  28.24 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  24.78 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>