12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6838 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  69.93 
 
 
153 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3427  hypothetical protein  47.92 
 
 
147 aa  144  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0483  hypothetical protein  45.39 
 
 
172 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  26.4 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  26.4 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  26.13 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  24.78 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  24.32 
 
 
128 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  28.04 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  28.46 
 
 
168 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  24.24 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>