34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2324 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2163  hypothetical protein  45.37 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  40.91 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  31.01 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  31.45 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  36.44 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  32.82 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  31.78 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  37.27 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  33.62 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  30.53 
 
 		 638 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  29.51 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  29.08 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  30.33 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  29.6 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  29.6 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  29.37 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  30.36 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  30.33 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  29.57 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  29.46 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  30.17 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3427  hypothetical protein  26.02 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30869  predicted protein  28.8 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.439697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>