33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4973 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  76.6 
 
 		 145 aa  237  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  55.07 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  51.56 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  47.79 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  40.74 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  32.39 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  30.65 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  35.07 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  28.8 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  32.03 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  35 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  31.01 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  31.78 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  30.58 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  30.58 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  35.77 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  35.34 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  30.15 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  30.15 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  31.01 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  26.77 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  26.77 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  27.61 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  25.36 
 
 		 638 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  23.64 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6016  hypothetical protein  31 
 
 		 435 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>