30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8422 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  50.35 
 
 		 144 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  45 
 
 		 145 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  40.74 
 
 		 149 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  41.43 
 
 		 138 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  38.06 
 
 		 145 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  33.81 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  33.07 
 
 		 138 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  30.6 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  27.74 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  27.74 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  25.32 
 
 		 638 aa  58.9  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  28.06 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  31.58 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  29.32 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  26.36 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  26.98 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  32.81 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  29.27 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  32.81 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  28.24 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  27.56 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  27.34 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  29.01 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  28.28 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  25.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  28 
 
 		 133 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>