35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3077 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  60.77 
 
 
130 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  55.56 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  51.59 
 
 
128 aa  147  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  37.8 
 
 
150 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  28.99 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  32.59 
 
 
638 aa  71.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  32.54 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  33.06 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  30.25 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  33.93 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  30.51 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  30.25 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  24.81 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  29.41 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  28.35 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  27.78 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  26.92 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  26.4 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  27.64 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  27.43 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  29.06 
 
 
149 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  29.06 
 
 
149 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0483  hypothetical protein  24.46 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  27.83 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3427  hypothetical protein  25.81 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  23.58 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  21.62 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  26.55 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  27.52 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.272221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>