37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0112 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  46.28 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  38.69 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  40.48 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  38.98 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  40.52 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  36.67 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  38.4 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  39.66 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  37.9 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  45 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  36.97 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  33.07 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  33.04 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  32.74 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  30.65 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  33.61 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  34.09 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  27.87 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  33.06 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  35.09 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  28.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  28.03 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  32.43 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  31.75 
 
 		 146 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>