30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0281 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  42.75 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  33.57 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  30.89 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  30.89 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  29.63 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  36.13 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  34.4 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  32.8 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  31.9 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  30.58 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  35.77 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  29.55 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  33.61 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  31.97 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  33.86 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  26.21 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  29.57 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  28.7 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  42.86 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  26.5 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  27.13 
 
 
223 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  28.18 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  24.44 
 
 
144 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  26.55 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>