38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0111 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  44.83 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  41.94 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  37.96 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  41.73 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  34.71 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  37.8 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  39.84 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  36.64 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  35.83 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  35.83 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  39.17 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  39.69 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  41.8 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  33.87 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  33.88 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  30.83 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  36.44 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  33.87 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  32.81 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0483  hypothetical protein  31.06 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  26.27 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  29.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  24.8 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3427  hypothetical protein  28.93 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  28.12 
 
 		 638 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  22.31 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  22.31 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  24.56 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  26.79 
 
 		 153 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  23.66 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>