58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0101 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  67.36 
 
 
150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  65.1 
 
 
148 aa  207  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  64.71 
 
 
148 aa  196  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  60.81 
 
 
149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  57.35 
 
 
146 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  161  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  161  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  45.11 
 
 
149 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  43.17 
 
 
168 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  37.96 
 
 
143 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  40.52 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  41.32 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  36.13 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  36.09 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  28.67 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  29.84 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  31.06 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  33.57 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  31.36 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  30.51 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  30.51 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  26.57 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  33.59 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  30.16 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  33.59 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  31.78 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  30.16 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  31.78 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  31.01 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  31.01 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  29.06 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  31.01 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  29.84 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  28.57 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  28.18 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  32.23 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  24.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  23.44 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  23.44 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  22.76 
 
 
638 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  30.09 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  25.78 
 
 
223 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>