39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0282 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  47.24 
 
 
138 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  35.83 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  33.87 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  39.53 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  36.67 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  37.1 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  33.06 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  34.68 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  34.45 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  34.45 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  35.4 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  34.51 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  34.51 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  31.45 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  30.47 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  31.4 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  35.43 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  31.54 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  31.4 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  29.75 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  36.07 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  32.48 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  29.63 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  30.66 
 
 
638 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  32.76 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  28.69 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  26.36 
 
 
223 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  28.93 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  28.07 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>