36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2023 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  98.65 
 
 
148 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  98.65 
 
 
148 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  98.65 
 
 
148 aa  299  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  97.3 
 
 
148 aa  296  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  87.84 
 
 
148 aa  276  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  87.16 
 
 
148 aa  274  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  73.65 
 
 
148 aa  234  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  74.32 
 
 
148 aa  234  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  72.97 
 
 
148 aa  233  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  38.28 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  39.37 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  36.09 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  33.83 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  31.78 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  27.91 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  27.59 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  25.6 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  28.33 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  22.69 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>