36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0472 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  93.15 
 
 		 146 aa  278  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  66.93 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  66.14 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  44.52 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  43.84 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  40.97 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  40.97 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  40.97 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  40.97 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  40.28 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  43.18 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  39.58 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  28.95 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  25.19 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  23.44 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  25.18 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  27.86 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  24.31 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  26.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  24.31 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  21.54 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>