37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3283 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  97.97 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  90.54 
 
 
148 aa  283  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  74.32 
 
 
148 aa  235  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  74.32 
 
 
148 aa  234  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  74.32 
 
 
148 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  74.32 
 
 
148 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  74.32 
 
 
148 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  72.3 
 
 
148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  42.42 
 
 
146 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  35.16 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  34.65 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  32.28 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  30.16 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  31.75 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  27.07 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  24.81 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  26.27 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  24.37 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  25.64 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  25.64 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>