34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2681 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  99.32 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  98.65 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  98.65 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  97.97 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  97.3 
 
 		 148 aa  296  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  88.51 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  87.84 
 
 		 148 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  74.32 
 
 		 148 aa  237  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  74.32 
 
 		 148 aa  237  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  75 
 
 		 148 aa  237  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  38.28 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  39.37 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  36.09 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  33.83 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  31.01 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  31.67 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  32.09 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  27.13 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  25.22 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  26.72 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  24.8 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  27.5 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  22.69 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>