33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2892 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  77.54 
 
 		 149 aa  233  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  52.76 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  52.9 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  52.8 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  38.06 
 
 		 223 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  30.66 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  36.09 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  31.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  33.59 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  34.71 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  31.85 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  30.89 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  29.46 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  26.92 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  33.61 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  26.92 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  35.25 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  29.91 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  34.23 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  31.03 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  28.23 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  27.01 
 
 		 638 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  26.27 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  24.55 
 
 		 143 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>