34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9172 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9172  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3444  hypothetical protein  69.77 
 
 
138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4502  hypothetical protein  60.71 
 
 
144 aa  177  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2892  3-dehydroquinate dehydratase  52.76 
 
 
145 aa  153  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4973  3-dehydroquinate dehydratase  51.56 
 
 
149 aa  153  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0795132  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8422  hypothetical protein  44.44 
 
 
223 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  39.02 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  34.56 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  33.9 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2495  hypothetical protein  34.38 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0808405  normal  0.0544241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  34.09 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  32.09 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1825  hypothetical protein  36 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177605  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  33.09 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7291  predicted protein  35.71 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  27.27 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  27.27 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0281  hypothetical protein  36.13 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0111  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  30.89 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  27.74 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  30.4 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2136  hypothetical protein  32.74 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  27.87 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46041  predicted protein  28.67 
 
 
638 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  28.79 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  30.89 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  27.97 
 
 
149 aa  47.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  27.97 
 
 
149 aa  47.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  29.41 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2163  hypothetical protein  29 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51352  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  27.91 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.24364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>