10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5543 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5543  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6838  hypothetical protein  69.93 
 
 		 153 aa  224  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145689  normal  0.174695 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3427  hypothetical protein  48.61 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0483  hypothetical protein  43.06 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4057  hypothetical protein  25.64 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  21.62 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  21.62 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2324  hypothetical protein  29.63 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.272221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4624  hypothetical protein  24.32 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3239  EIF2Aa; initiation factor  24.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0254184  normal  0.905261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>