56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4797 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  57.31 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  55.25 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  52.87 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  54.72 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  56.1 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  52.14 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  54.81 
 
 		 262 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  47.88 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  46.72 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  46.96 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  42.68 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  49.04 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  44.5 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  37.76 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  36.05 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  34.6 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  30.49 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  34.42 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  28.85 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.37 
 
 		 298 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.7 
 
 		 338 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  31.25 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  27.88 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  31.25 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  31.25 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  31.25 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  29.41 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  32.14 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  37.14 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  37.14 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  32.14 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  32.14 
 
 		 364 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  37.14 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  28.76 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  36.19 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  30.36 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  32.14 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  27.27 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  31.69 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  30.53 
 
 		 364 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  39.44 
 
 		 367 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  25.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  25.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  25.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  25.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  25.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  25.93 
 
 		 247 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>