More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4745 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  100 
 
 		 321 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  58.5 
 
 		 318 aa  328  6e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  52.79 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  51.77 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  51.16 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  49.83 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  50.47 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  49.84 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  43.03 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  44.53 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  38.6 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  38.25 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  37.41 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.23 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  26.69 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  31.38 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  29.3 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  30 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  31.2 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  29.63 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  28.15 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  28.12 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  30.28 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  30.59 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  32.53 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.74 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  30.59 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  22.98 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  27.03 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  35.98 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  27.39 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  30.13 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  28.52 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  28.48 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.49 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  29.77 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  28.74 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  28.39 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  32.24 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  26.38 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  27.04 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  30.4 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  27.95 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  28.98 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  27.95 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.93 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.09 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  24.43 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  26.76 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  28.01 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  29.55 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  25.65 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.47 
 
 		 471 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  29.28 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  28.98 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  21.93 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  41.86 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  23.72 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0299  diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed)  35.62 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.802768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  41.58 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  41.58 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  29.69 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  31.51 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  31.45 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.48 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  29.67 
 
 		 541 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  41.58 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  31.49 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  26.4 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7710  diacylglycerol kinase catalytic region  42.86 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3383  diacylglycerol kinase catalytic region  26.69 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  28.22 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  28.43 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  25.37 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1759  sphingosine kinase  34.15 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  36.15 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  32.21 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  31.11 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  26.09 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.09 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  27.5 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  27.53 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  35.92 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  39.52 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.17 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1968  diacylglycerol kinase catalytic region  28.24 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.4 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  35.82 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  29.56 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.84 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  39.6 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  22.56 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  32.88 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>