More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0299 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0299  diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed)  100 
 
 		 371 aa  767    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.802768 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1759  sphingosine kinase  67.96 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  36 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  40.54 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01650  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  39.94 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0378  diacylglycerol kinase catalytic region  39.58 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal  0.4677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.94 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  35.58 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3243  diacylglycerol kinase catalytic region  37.17 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  35 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  36.14 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06820  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  36.92 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01680  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  34.19 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.633077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.86 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  34.51 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0284  diacylglycerol kinase catalytic region  32.26 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.34604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  32.39 
 
 		 302 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.4 
 
 		 506 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  36.86 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3406  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  28.34 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  31.12 
 
 		 309 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  27.9 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  30.9 
 
 		 304 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.53 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  30.56 
 
 		 610 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0324329  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  27.64 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  27.04 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  31.69 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  27.36 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  30.91 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  32.98 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.4 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  31.31 
 
 		 294 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  24.46 
 
 		 300 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  30.54 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  28.89 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  35.23 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  28.16 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  28.04 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1757  diacylglycerol kinase catalytic region  24.29 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  27.76 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  31.13 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  29.35 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  26.84 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  28.51 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  27.78 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  26.88 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  26.24 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  27.41 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2567  diacylglycerol kinase catalytic region  27.1 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  25.32 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4839  diacylglycerol kinase catalytic region  27.24 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0439501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  27.27 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1293  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.64 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.13381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  31.96 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  28.86 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  30.58 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0561  diacylglycerol kinase, catalytic region  23.7 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.323865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  28.93 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  31.07 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  31.07 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  27.22 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0576  diacylglycerol kinase catalytic region  23.7 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  27.05 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  31.07 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30690  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  27.86 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0030  diacylglycerol kinase catalytic region  29.13 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6288  diacylglycerol kinase catalytic region  25.45 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.29 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  34.81 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  31.72 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  27.08 
 
 		 560 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  29.58 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  27.13 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  24.61 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  26.18 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  28.71 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  29.44 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3375  diacylglycerol kinase  32.12 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  26.77 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3437  diacylglycerol kinase  32.12 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00697361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3386  diacylglycerol kinase  32.12 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  26.1 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  27.73 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  26.79 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26.3 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  28.57 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  28.57 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  27.16 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  36.29 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0225  diacylglycerol kinase catalytic region  28.94 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000001746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  35.62 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  31.33 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  40.82 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  28.87 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  25 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  40.82 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0717  diacylglycerol kinase catalytic region  26.63 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.478099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2187  diacylglycerol kinase catalytic region  25.27 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.670383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>