More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4888 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  100 
 
 
299 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  98.66 
 
 
299 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  86.62 
 
 
299 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  39.15 
 
 
355 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  35.62 
 
 
303 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  34.87 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  35.46 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  35.69 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  36.61 
 
 
312 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  35.29 
 
 
307 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  32.84 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  34.88 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  30.77 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  37.87 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  29.04 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  27.45 
 
 
287 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  35.27 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  30.77 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  32.43 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  30.96 
 
 
302 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  30.96 
 
 
302 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  31.88 
 
 
309 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  31.89 
 
 
300 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  31.88 
 
 
309 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.48 
 
 
305 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  32.48 
 
 
305 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.17 
 
 
306 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  32.97 
 
 
299 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  32.05 
 
 
321 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  29.71 
 
 
308 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  31.15 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  30.83 
 
 
302 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  30.36 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  30.25 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  29.79 
 
 
226 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  31.67 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  31.99 
 
 
305 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  29.41 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.76 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  28.67 
 
 
343 aa  92.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  31.06 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  31.94 
 
 
291 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  28.17 
 
 
284 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  31.41 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.54 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  30.59 
 
 
321 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.71 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  30.51 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  29.7 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  32.37 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  29.46 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  29.14 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  30.89 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  32.26 
 
 
364 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.23 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  31.72 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.14 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  30.67 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  38.89 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  29 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  24.81 
 
 
304 aa  79  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  25.19 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  30.13 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  43.93 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  26.88 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  28.85 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3406  diacylglycerol kinase catalytic region  32.56 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.17 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
506 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  27.42 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  29.76 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  30.73 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.87 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  36.42 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  26.4 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  30.63 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  34.15 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.8 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1759  sphingosine kinase  39.8 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1090  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.93 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  24.48 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  25.93 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1643  diacylglycerol kinase catalytic region  43.82 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2891  diacylglycerol kinase catalytic region  31.51 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0299  diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed)  40.82 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.802768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  31.39 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  28 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16010  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  29.76 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1735  diacylglycerol kinase catalytic region  27.78 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.137383  decreased coverage  0.00310511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  27.08 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  26.06 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  26.36 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  37.69 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  33.46 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0633  diacylglycerol kinase catalytic region  22.36 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000157302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2741  diacylglycerol kinase catalytic region  24.58 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  30.1 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1757  diacylglycerol kinase catalytic region  27.23 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  24.05 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  37.5 
 
 
361 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>