247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3289 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  100 
 
 
355 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  39.57 
 
 
299 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  39.15 
 
 
299 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  37.72 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  32.44 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.29 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  28.9 
 
 
307 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  30 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  30 
 
 
305 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  23.18 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  32.55 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  26.81 
 
 
314 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  31.06 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  32.42 
 
 
312 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  31.17 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  29.55 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  26.13 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  27.63 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  24.31 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  27.33 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  28.76 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  30.59 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  26.67 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  27.46 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1090  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.75 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  29.09 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  26.97 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  30 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  29.6 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  30 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  39.29 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  32.73 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.02 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  29.13 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  29.2 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.24 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  23.24 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  39.29 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  28.32 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  39.29 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  29.92 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  29.91 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.94 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  31.35 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  27.21 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2891  diacylglycerol kinase catalytic region  31.56 
 
 
310 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  30.36 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  46.43 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  30.88 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  27.33 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  27.97 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  28.86 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  27.39 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.26 
 
 
506 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  28.81 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  26.37 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  32.12 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  28.46 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  27.85 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  34.72 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  24.89 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  27.69 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.04 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  31.39 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.44 
 
 
274 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  25.17 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  33.33 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.73 
 
 
471 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  29.69 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  42.68 
 
 
310 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4192  diacylglycerol kinase catalytic region  31.79 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.128995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.35 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0458  hypothetical protein  31.14 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.61391  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  28.85 
 
 
302 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  35.45 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  27.86 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  34.88 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  24.9 
 
 
300 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  29.68 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  29.66 
 
 
533 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  26.15 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0264  diacylglycerol kinase catalytic region  57.14 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0284  diacylglycerol kinase catalytic region  26.04 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.34604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  27.76 
 
 
317 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  25.23 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.11 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  25.1 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  24.38 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  30.58 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3185  diacylglycerol kinase catalytic region  55.56 
 
 
379 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  0.0401466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  32.39 
 
 
565 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.69 
 
 
489 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  32.39 
 
 
565 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  30.57 
 
 
560 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1862  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.66 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  32.8 
 
 
550 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  22.49 
 
 
300 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  31.02 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>