148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1500 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  100 
 
 
433 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0890  diacylglycerol kinase catalytic region  46.55 
 
 
430 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3383  diacylglycerol kinase catalytic region  44.94 
 
 
403 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6593  diacylglycerol kinase catalytic region  41.71 
 
 
440 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3443  diacylglycerol kinase catalytic region  38.02 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000406653  hitchhiker  0.000176251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  40.96 
 
 
541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.34 
 
 
496 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.34 
 
 
496 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.34 
 
 
496 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.2 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.96 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.94 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  30.64 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3059  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.92 
 
 
519 aa  73.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.450638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.85 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  32.58 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  28.85 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.97 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0196  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.59 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  28.43 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  29.8 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  26.94 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  29.19 
 
 
305 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  26.3 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  29.54 
 
 
318 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  26.69 
 
 
309 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  23.74 
 
 
545 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  25.94 
 
 
565 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  25.31 
 
 
565 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  25.31 
 
 
565 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.78 
 
 
305 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.2 
 
 
489 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  26.78 
 
 
305 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.5 
 
 
533 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  31.6 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  25.34 
 
 
321 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  21.67 
 
 
287 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.49 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.51 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  27.12 
 
 
305 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  30.43 
 
 
299 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  26.28 
 
 
308 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.7 
 
 
497 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  25 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2246  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.53 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0627766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  39.56 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  24.84 
 
 
550 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  26.4 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  30.04 
 
 
299 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  28.77 
 
 
303 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1734  diacylglycerol kinase catalytic region  28.3 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  28.43 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  34.03 
 
 
335 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  25.34 
 
 
298 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  27.82 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  33.51 
 
 
316 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  25.34 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  22.37 
 
 
547 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  32.67 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  29.93 
 
 
293 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  27.51 
 
 
317 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  23.92 
 
 
293 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  25.84 
 
 
284 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  26 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.67 
 
 
535 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  decreased coverage  0.00202108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1968  diacylglycerol kinase catalytic region  28.06 
 
 
334 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  29.1 
 
 
311 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  27.18 
 
 
309 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  31.47 
 
 
314 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1111  diacylglycerol kinase catalytic region  26.27 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  29.79 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  31.47 
 
 
314 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3762  diacylglycerol kinase  26.47 
 
 
300 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  35.43 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  28.05 
 
 
307 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  33.33 
 
 
328 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  25.32 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  27.39 
 
 
304 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  23.84 
 
 
552 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  27.37 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3700  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.16 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  23.21 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  22.97 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  28.83 
 
 
295 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0601  diacylglycerol kinase catalytic region  26.45 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.902429  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  28.52 
 
 
288 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 
302 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0299  diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed)  26.95 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.802768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  28.83 
 
 
295 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  31.08 
 
 
308 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4080  diacylglycerol kinase catalytic region  25.16 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  24.34 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  25.32 
 
 
317 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  26.2 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  25.51 
 
 
292 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  29.48 
 
 
332 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  32.48 
 
 
310 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  34.9 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3630  diacylglycerol kinase catalytic region  30.85 
 
 
336 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  22.64 
 
 
302 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>