273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2359 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  100 
 
 
343 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  63.11 
 
 
343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  60.97 
 
 
332 aa  329  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  55 
 
 
318 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  52.79 
 
 
321 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  50.33 
 
 
323 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  46.51 
 
 
321 aa  245  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  46.18 
 
 
321 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  42.5 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  44.11 
 
 
372 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  34.71 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  35.98 
 
 
305 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.67 
 
 
305 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.65 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  29.24 
 
 
299 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  30.51 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  28.9 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.39 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  31.23 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.33 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  28.74 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  27.94 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  30.74 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  28.08 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  26.98 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  27.82 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  27.8 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  35.9 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  29.96 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.69 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  28.16 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  27.72 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.13 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.13 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.13 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  24.66 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  27.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  30.22 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  30.25 
 
 
506 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  21.67 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  26.49 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  26.91 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  25.78 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  25.58 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  23.33 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  28.57 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.74 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  28.19 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  29.78 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  27.71 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  24.91 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  24.91 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.19 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  22.95 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1968  diacylglycerol kinase catalytic region  28.84 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  26.98 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  32.68 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  28.03 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2246  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.1 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0627766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  26.05 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  26.05 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  29.72 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  28.41 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.43 
 
 
489 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0299  diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed)  28.8 
 
 
371 aa  67  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.802768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  29.76 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  21.2 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.87 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  28.27 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  22.95 
 
 
296 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  25.08 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  30.99 
 
 
291 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  28.75 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  21.55 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  25.28 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3059  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.27 
 
 
519 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.450638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26.34 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  28.7 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  36.54 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  32.14 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  34.52 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  28.12 
 
 
309 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  28.06 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0196  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.3 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4345  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.02 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  26.7 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  26.7 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  29.35 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.38 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  22.74 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2741  diacylglycerol kinase catalytic region  25 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  26.12 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  27.54 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  39.24 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  30.81 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  25.75 
 
 
312 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0800  hypothetical protein  26.6 
 
 
292 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0561  diacylglycerol kinase, catalytic region  22.55 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.323865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>