More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3059 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3059  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  100 
 
 
519 aa  1022    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.450638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.7 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.7 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.7 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.3 
 
 
497 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  63.12 
 
 
497 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0196  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  55.58 
 
 
490 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.13 
 
 
533 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.41 
 
 
535 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  decreased coverage  0.00202108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.72 
 
 
499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.25 
 
 
471 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3916  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.58 
 
 
498 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  40.54 
 
 
506 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  38.61 
 
 
480 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.46 
 
 
489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2246  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.4 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0627766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  47.27 
 
 
199 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0450  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.45 
 
 
205 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  32.64 
 
 
293 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0368  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.12 
 
 
215 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  30 
 
 
326 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  29.07 
 
 
291 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.78 
 
 
302 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3383  diacylglycerol kinase catalytic region  29.76 
 
 
403 aa  90.5  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  35.65 
 
 
541 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  27.34 
 
 
291 aa  87.8  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  33.33 
 
 
317 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0890  diacylglycerol kinase catalytic region  32.27 
 
 
430 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  28.99 
 
 
308 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  28.47 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  28.11 
 
 
309 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  30.22 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  26.96 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  26.62 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  28.93 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  28.69 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.4 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3443  diacylglycerol kinase catalytic region  38.57 
 
 
444 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000406653  hitchhiker  0.000176251 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.74 
 
 
306 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.22 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  27.76 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6593  diacylglycerol kinase catalytic region  31.88 
 
 
440 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.43 
 
 
305 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  30.58 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  27.27 
 
 
226 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  29.43 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  27.45 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  27.53 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  27.53 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  31.75 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  31.85 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  30.34 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.22 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  28.43 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0756  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.66 
 
 
190 aa  73.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  25.9 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  28.46 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.12 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  28 
 
 
305 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.5 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.12 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  25.5 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  25.5 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  25.5 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3667  putative lipid kinase  34.16 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  28.89 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  25.5 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3598  putative lipid kinase  33.74 
 
 
297 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  25.5 
 
 
300 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  26.29 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3510  putative lipid kinase  33.33 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  27.54 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  28.1 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1643  diacylglycerol kinase catalytic region  28.63 
 
 
285 aa  66.6  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.79 
 
 
178 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0633  diacylglycerol kinase catalytic region  22.92 
 
 
301 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000157302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.1 
 
 
323 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.77 
 
 
194 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  30.38 
 
 
291 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  31.8 
 
 
302 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  23.81 
 
 
310 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  28.46 
 
 
287 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  30.2 
 
 
185 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.59 
 
 
172 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.23 
 
 
200 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.83 
 
 
174 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  29.29 
 
 
321 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  27.59 
 
 
335 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  24.68 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.48 
 
 
178 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.48 
 
 
178 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21940  conserved protein of unknown function BmrU  28.51 
 
 
304 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  0.451971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 
186 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.99 
 
 
196 aa  62  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.17 
 
 
312 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5857  hypothetical protein  30.97 
 
 
291 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.23 
 
 
320 aa  60.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.44 
 
 
191 aa  60.1  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>