289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2183 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  58.5 
 
 
321 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  56.13 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  56.39 
 
 
323 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  52.61 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  52.96 
 
 
321 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1722  hypothetical protein  50 
 
 
332 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0741572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  49.69 
 
 
343 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  42.19 
 
 
335 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  46.09 
 
 
372 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  37.58 
 
 
306 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  40.74 
 
 
305 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  40.74 
 
 
305 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.39 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  33.2 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  31.58 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.26 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  29.84 
 
 
299 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  30.23 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  30.69 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  29.21 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  29.57 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  28.23 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  25.52 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  24.44 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  31.3 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.16 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  30.2 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  29.35 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  26.23 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  25.34 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  29.32 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.35 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  29.9 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  25.47 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  31.22 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  30 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  28.03 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  26.38 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  26.38 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  23.88 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  27.01 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  29.83 
 
 
506 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  31.02 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  34.13 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  34.04 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  27.67 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  26.44 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  30.11 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  27.59 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  24.83 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.86 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  25.63 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  30.83 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  27.36 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  29.73 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.2 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  31.21 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.62 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  28.87 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  27.67 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  23.92 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  33.87 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  30.4 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.7 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.7 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.7 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.35 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.01 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  22.98 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.58 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26.21 
 
 
310 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  22.86 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  26.43 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  27.44 
 
 
371 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  28.46 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  32.79 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  22.95 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  25.51 
 
 
545 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  28.57 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  27.5 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  27.5 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0299  diacylglycerol kinase catalytic domain (presumed)  30.15 
 
 
371 aa  62.4  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.802768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  27.5 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1968  diacylglycerol kinase catalytic region  31.9 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7710  diacylglycerol kinase catalytic region  33.91 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  23.69 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  27 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  38.69 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  29.59 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  29.77 
 
 
435 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  27 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4589  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.01 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  30.08 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  27 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  27 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  28.69 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  27 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  29.27 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  27 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>