82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3638 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0828  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0989333  normal  0.0109928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.93 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  49.06 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2223  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000613691  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3068  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  41.51 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0807  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  29.79 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.79 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.79 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2257  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2373  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  35.38 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  34.62 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  29.69 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0970  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000688718  hitchhiker  0.00467442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4699  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  29.03 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.48 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  21.98 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.74 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 108 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0469  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1080  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707346  normal  0.216609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  38.24 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.13 
 
 		 112 aa  40  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.36 
 
 		 99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>