255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0577 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4812  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.05 
 
 
472 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04108  fused trehalose(maltose)-specific PTS enzyme: IIB component/IIC component  69.05 
 
 
473 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04072  hypothetical protein  69.05 
 
 
473 aa  663    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3754  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  68.61 
 
 
473 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4706  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69 
 
 
472 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000162291  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4721  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.05 
 
 
473 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.612827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4737  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.21 
 
 
472 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004235  phosphotransferase system trehalose-specific IIBC component  86.29 
 
 
474 aa  834    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4835  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  68.79 
 
 
472 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4856  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69 
 
 
472 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000588436  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3771  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  68.83 
 
 
473 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1163  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.76 
 
 
483 aa  674    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.348607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4843  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  68.83 
 
 
472 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4494  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.05 
 
 
472 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2757  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70.56 
 
 
472 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1507  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.43 
 
 
472 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0577  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  100 
 
 
474 aa  951    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0522  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  79.53 
 
 
486 aa  763    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0439  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70.56 
 
 
473 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5762  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.05 
 
 
473 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742409  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0432  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  83.97 
 
 
478 aa  824    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4801  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  69.43 
 
 
472 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.318828  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0529  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  70.49 
 
 
471 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.702922  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0431  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.34 
 
 
471 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01205  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  87.39 
 
 
468 aa  839    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0495  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  71.55 
 
 
471 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0769  PTS system trehalose(maltose)-specific transporter subunits IIBC  61.91 
 
 
474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0077  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  53.22 
 
 
643 aa  496  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.569592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0541  PTS system, trehalose-specific IIBC component  54.06 
 
 
473 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1335  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  50.72 
 
 
497 aa  481  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135548  hitchhiker  0.00345051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0473  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  52.77 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0192  PTS system, IIABC components  48.76 
 
 
676 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2418  PTS system, glucose-like IIB subunint  48.78 
 
 
489 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000324347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0598  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  41.18 
 
 
475 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0356425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0631  PTS system trehalose-specific transporter subunit IIBC  41.18 
 
 
475 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0760  PTS system, trehalose-specific IIBC component  41.18 
 
 
475 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0699  PTS system, trehalose-specific IIBC component  41.18 
 
 
475 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.712537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  40.97 
 
 
475 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0686  PTS system, trehalose-specific IIBC component  40.97 
 
 
475 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.872474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0667  PTS system, trehalose-specific IIBC component  40.97 
 
 
475 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0542  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (PTS system, trehalose-specific IIBC component)  40.97 
 
 
475 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4670  PTS system, trehalose-specific IIBC component  40.97 
 
 
475 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.21575e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1620  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  41.68 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000938635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2554  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  42.12 
 
 
472 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0544  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  40.97 
 
 
475 aa  348  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2403  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.59 
 
 
480 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000860113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2449  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.59 
 
 
480 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000521739  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0597  PTS system, sucrose-specific IIBC component  37.11 
 
 
479 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000306243  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000599  phosphotransferase system sucrose-specific IIBC component  35.46 
 
 
479 aa  309  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000683079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0495  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  37.58 
 
 
475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.247391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0508  PTS system, trehalose-specific IIBC subunit  37.58 
 
 
475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl500  trehalose PTS system IIABC component  38.53 
 
 
519 aa  303  5.000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1968  PTS system, sucrose-specific IIBC components  36.67 
 
 
481 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000108474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0972  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.55 
 
 
485 aa  299  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0102663  normal  0.021269 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0525  PTS system, trehalose-specific IIB component  56.25 
 
 
273 aa  296  8e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3657  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.06 
 
 
478 aa  292  9e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3507  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  36.11 
 
 
458 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2907  PTS system sucrose-specific EIIBC component ScrA  34.63 
 
 
456 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119328  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3757  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.91 
 
 
456 aa  249  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3594  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.29 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0393  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.14 
 
 
457 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0349  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  34.55 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2021  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.65 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4205  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  35.5 
 
 
456 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  32.85 
 
 
653 aa  241  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1285  PTS system, sucrose-specific (IIBC component) transmembrane protein  33.26 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.484299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3433  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  33.41 
 
 
462 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  32.49 
 
 
647 aa  232  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1785  PTS system, sucrose-specific IIBC component  32.05 
 
 
450 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000306537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1513  PTS system, sucrose-specific IIBC component  33.26 
 
 
450 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000189676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0810  PTS system, sucrose-specific IIBC component  31.77 
 
 
458 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0718  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  31.77 
 
 
458 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000127924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0754  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  31.77 
 
 
458 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0398  sucrose PTS, EIIBCA  35.76 
 
 
654 aa  216  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000327344  hitchhiker  0.00000162153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0917  PTS system, sucrose-specific IIBC component  31.56 
 
 
458 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0668  PTS system, sucrose-specific IIBC component  31.56 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00638232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1690  PTS system, IIABC components  32.01 
 
 
639 aa  210  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0253  PTS system, glucose-like IIB subunint  32.83 
 
 
474 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00830451  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  30.79 
 
 
633 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl431  trehalose/sucrose/beta-glucoside PTS system IIBC component  29.96 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0282  PTS system, IIBC components  31.77 
 
 
461 aa  196  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3482  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  30.9 
 
 
644 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.11 
 
 
626 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1470  phosphotransferase system EIIC  28.42 
 
 
450 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0563215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  28.47 
 
 
638 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0859  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  29.7 
 
 
630 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl516  sucrose PTS system IIBC component  28.34 
 
 
572 aa  180  4.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.804375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4064  phosphotransferase system EIIC  29.26 
 
 
462 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0877  PTS system, beta-glucoside-specific enzyme II, ABC component  29.96 
 
 
630 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4255  phosphotransferase system EIIC  28.54 
 
 
460 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4074  phosphotransferase system EIIC  29.22 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0733  phosphotransferase system EIIC  27.07 
 
 
454 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0877  PTS system, sucrose-specific IIBC component  27.07 
 
 
454 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2812  phosphotransferase system EIIC  28.07 
 
 
454 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4458  PTS system, sucrose-specific IIBC component  27.07 
 
 
454 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222368  normal  0.618386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0988  PTS system, sucrose-specific IIBC component  27.29 
 
 
454 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0919  PTS system, sucrose-specific IIBC component  27.07 
 
 
454 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6517e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0784  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  27.07 
 
 
454 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0823  PTS system sucrose-specific transporter subunit IIBC  27.07 
 
 
454 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0719  PTS system, sucrose-specific IIBC component  26.86 
 
 
454 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>