More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2455 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  684    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  60.65 
 
 
319 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  64.47 
 
 
325 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  58.86 
 
 
321 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  61.87 
 
 
323 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  61.62 
 
 
323 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  62.88 
 
 
323 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  61.62 
 
 
323 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  60.4 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  59.75 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  62.16 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  61.28 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  63.48 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  60.61 
 
 
323 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  60.61 
 
 
323 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  60.61 
 
 
323 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  59.75 
 
 
323 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  60.61 
 
 
323 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  62.08 
 
 
323 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  58.81 
 
 
323 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  58.81 
 
 
323 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  59.8 
 
 
322 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  57.19 
 
 
332 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  59.06 
 
 
333 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  59.26 
 
 
323 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  58.92 
 
 
323 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  59.26 
 
 
332 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  58.92 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  58.67 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  58.92 
 
 
332 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  57.47 
 
 
332 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  58.39 
 
 
322 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  58.59 
 
 
332 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  60.14 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  59.72 
 
 
322 aa  354  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.01 
 
 
323 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  57.24 
 
 
324 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  54.83 
 
 
321 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  56.42 
 
 
319 aa  345  8e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  57.35 
 
 
312 aa  329  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  55.28 
 
 
312 aa  328  9e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  49.37 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  58.15 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  58.15 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.78 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  57.78 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  49.84 
 
 
321 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  57.78 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  56.41 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  50.48 
 
 
311 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  53.38 
 
 
333 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  47.32 
 
 
320 aa  297  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  46.89 
 
 
330 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  35.38 
 
 
270 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.08 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.08 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.34 
 
 
284 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.08 
 
 
272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  33.57 
 
 
302 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.82 
 
 
285 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  32.82 
 
 
301 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  30.53 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31.65 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  29.66 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  30.15 
 
 
303 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.97 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  29.48 
 
 
272 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  26.6 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.79 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  27.69 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.45 
 
 
273 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.57 
 
 
274 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  27.55 
 
 
274 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  27.78 
 
 
283 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.92 
 
 
325 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.39 
 
 
338 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  30.9 
 
 
302 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  24.92 
 
 
269 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  29.41 
 
 
285 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  26.98 
 
 
381 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  27.38 
 
 
273 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  29.43 
 
 
282 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  30.04 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.4 
 
 
558 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.44 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  28.84 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  29.28 
 
 
267 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  28.21 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  29.01 
 
 
272 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.04 
 
 
272 aa  95.9  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.9 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  28.52 
 
 
281 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  24.74 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  24.74 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  28.41 
 
 
264 aa  92.4  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.79 
 
 
272 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  29.92 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.11 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  27.6 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>