45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05718 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05718  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  92.31 
 
 		 285 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  42.55 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 305 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0654  HTH-type regulatory protein, AraC family  46.81 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3601  response regulator receiver domain-containing protein  44 
 
 		 278 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 544 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2328  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 327 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2142  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  45.24 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  45.24 
 
 		 338 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 344 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1854  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.191577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5741  helix-turn-helix domain-containing protein  46.81 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0844  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 298 aa  42  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1288  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 299 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0436335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 335 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  41.67 
 
 		 288 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  43.48 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  38.18 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  41.67 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 347 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.54 
 
 		 328 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1519  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 355 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0248055  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  40 
 
 		 1296 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3534  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 309 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0611769  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 364 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  40.43 
 
 		 356 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>