143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004275 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  100 
 
 
355 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  93.8 
 
 
356 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  73.16 
 
 
364 aa  552  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  75.71 
 
 
362 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.14 
 
 
356 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.66 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.45 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.7 
 
 
348 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.87 
 
 
346 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.89 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  48.8 
 
 
345 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0243  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.57 
 
 
344 aa  349  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00932819  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  49.85 
 
 
342 aa  348  9e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  49.85 
 
 
342 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.14 
 
 
340 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.45 
 
 
353 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.45 
 
 
348 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  50.46 
 
 
341 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.73 
 
 
336 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.81 
 
 
337 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.81 
 
 
337 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.81 
 
 
337 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.52 
 
 
349 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.51 
 
 
337 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.37 
 
 
346 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.54 
 
 
343 aa  329  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.92 
 
 
337 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.92 
 
 
337 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  47.32 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.51 
 
 
350 aa  323  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.92 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.62 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.6 
 
 
337 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.35 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  44.51 
 
 
338 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3660  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  49.03 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  38.5 
 
 
371 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  37.79 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.96 
 
 
426 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.46 
 
 
481 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.82 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  38.79 
 
 
334 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  36.45 
 
 
333 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  39.05 
 
 
510 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1973  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.27 
 
 
345 aa  225  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0907521 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.86 
 
 
339 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0932  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.65 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3124  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.04 
 
 
385 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1426  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.31 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1798  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.75 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000544657  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.82 
 
 
319 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
319 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.33 
 
 
318 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.16 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.85 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 
345 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.61 
 
 
337 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4403  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.95 
 
 
350 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3423  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.13 
 
 
401 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.76 
 
 
332 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  27.7 
 
 
335 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.06 
 
 
346 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05665  hypothetical protein  26.97 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  28.28 
 
 
335 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0849  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.3 
 
 
330 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.470492  normal  0.0879559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2432  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.84 
 
 
396 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362686  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000043  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.41 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.8 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.96 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3854  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.47 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.46 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4423  hypothetical protein  26.87 
 
 
331 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.81 
 
 
333 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.93 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3856  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.33 
 
 
357 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.404909  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4317  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.33 
 
 
346 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.925713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.69 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.16 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  25.8 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  27.87 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3861  ectoine utilization protein EutE  27.52 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.42 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.15 
 
 
346 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  28.24 
 
 
349 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.49 
 
 
344 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.82 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.34 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5881  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.15 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.76 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.15 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.15 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.52 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  26.19 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2694  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.91 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5522  ectoine utilization protein EutE  25.85 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516127 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.92 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  26.91 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  26.91 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  26.91 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  26.91 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>