68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004076 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  100 
 
 		 154 aa  322  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  54.73 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  42.03 
 
 		 197 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  38.69 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.85 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  37.93 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  41.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.55 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.96 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  37.24 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  36.55 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  34.48 
 
 		 177 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  35.17 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.03 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  35.25 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.25 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.89 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.72 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  37.58 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  37.58 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  38.93 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  36.24 
 
 		 179 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  32.88 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  30.26 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  28.87 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.43 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.88 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.88 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  31.97 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  28.06 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  27.54 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.54 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.74 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.74 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  25.9 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  27.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03890  hypothetical protein  26.81 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2120  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0692944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0436  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.68 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000377622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002758  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  27.01 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.941344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0642  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.34 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265176  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0351  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.47 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1858  hypothetical protein  24.63 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  24.79 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03226  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.55 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 497 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2804  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3270  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.9 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000286089  hitchhiker  0.0035838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1640  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.09 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  25.37 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2630  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.09 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000191637  normal  0.0828636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2697  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.09 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000017276  hitchhiker  0.00306361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0666  cylZ protein  26 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0613  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.63 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000688375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3185  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  23.02 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0283392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2416  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  24.82 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1150  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  22.56 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000017115  normal  0.719326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1359  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.36 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1101  hypothetical protein  29.21 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2965  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  28.57 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2624  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000168919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1565  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  20.3 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000561633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2874  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.74 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000356427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>