59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00772 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  73.47 
 
 		 157 aa  220  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  73.47 
 
 		 157 aa  220  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  68.71 
 
 		 165 aa  203  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  66.67 
 
 		 169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  62.42 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  56.21 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  56.21 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  40.69 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  36.05 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  34.33 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  34.56 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  33.11 
 
 		 167 aa  87.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  31.37 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.1 
 
 		 197 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.72 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  32.03 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  35.51 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  30.72 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.72 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  30.22 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.66 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.72 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  31.37 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.72 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  30.97 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.13 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  30.97 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  30.97 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  30.07 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.77 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  27.78 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.57 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  32.59 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  28.06 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  25 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  35.54 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2768  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  37.01 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2154  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  37.01 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03729  xanthomonadin biosynthesis phosphotransferase/dehydratase  34.11 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  35.16 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  33.96 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6098  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  35.78 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0926  (3R)-hydroxymyristoyl-acyl-carrier-protein dehydratase, putative  33.08 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 497 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2687  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  37.93 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1986  xanthomonadin biosynthesis protein  29.67 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2677  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  35.56 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0252517  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0937  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.959772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0794  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2820  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  35.63 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2064  phosphotransferase  28.57 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>