58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5108 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  312  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  90.07 
 
 		 151 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  70.07 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  46.1 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.81 
 
 		 167 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  40.58 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.67 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  33.77 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.99 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  34.42 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  35.86 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  31.65 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  31.65 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  31.65 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  31.68 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  33.33 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  34 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  33.33 
 
 		 178 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.46 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  39.42 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  38.62 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  38.3 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  38.81 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  34 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.82 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.82 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.36 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  37.88 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  34.56 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  37.5 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  36.03 
 
 		 157 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  35.34 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.09 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.81 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.81 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.66 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.53 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  35.07 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  32.41 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0937  hypothetical protein  36.46 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.959772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0794  hypothetical protein  36.46 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 497 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0926  (3R)-hydroxymyristoyl-acyl-carrier-protein dehydratase, putative  32.98 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03729  xanthomonadin biosynthesis phosphotransferase/dehydratase  31.87 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2677  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  34.38 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0252517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  32.97 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1986  xanthomonadin biosynthesis protein  31.52 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2064  phosphotransferase  31.52 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  34.34 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03890  hypothetical protein  25.58 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  32.63 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  31.52 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1101  hypothetical protein  26.02 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1858  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>