61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3695 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 157 aa  320  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 157 aa  320  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  73.47 
 
 		 158 aa  231  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  60.26 
 
 		 165 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  60.78 
 
 		 169 aa  187  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  55.1 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  55.1 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  54.73 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  40.14 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  34.48 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  35.82 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  33.12 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.97 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  32 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.33 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.79 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  35.25 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  28.1 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  30.6 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  27.45 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.14 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  28.76 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.45 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  28.76 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.29 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  31.88 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  28.3 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  28.76 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  27.67 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  27.67 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  30.38 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  31.11 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.62 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  25.93 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03729  xanthomonadin biosynthesis phosphotransferase/dehydratase  35.34 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  26.09 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2768  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  35.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2154  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  35.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1986  xanthomonadin biosynthesis protein  32.28 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  36.19 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  35.24 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  25.85 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6098  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  37.96 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  34.29 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2064  phosphotransferase  31.5 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  32.08 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0926  (3R)-hydroxymyristoyl-acyl-carrier-protein dehydratase, putative  39.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2677  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  37.96 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0252517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  35.43 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0937  hypothetical protein  33.67 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.959772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0794  hypothetical protein  33.67 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2687  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  33.64 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  32.03 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1326  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  36.27 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0256156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  29.5 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3306  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2820  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  31.82 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>