55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0106 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0106  dehydratase  100 
 
 		 150 aa  309  5.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  39.42 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.55 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  37.67 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  35.25 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  33.55 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  34.84 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  35.34 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  32.41 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  36.05 
 
 		 177 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.9 
 
 		 178 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  36.17 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  35.42 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  31.37 
 
 		 180 aa  87  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  35.97 
 
 		 167 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  33.33 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  31.97 
 
 		 179 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  31.97 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  31.97 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.43 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.66 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.67 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.34 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  30.88 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  28.89 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  31.97 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  29.08 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  28.08 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  28.99 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.18 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.28 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  28.28 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.77 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  27.66 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 497 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.12 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.12 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  33.71 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0545  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.55 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.333587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  27.36 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3925  hypothetical protein  39.19 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.925747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2768  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  25.89 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2154  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  25.89 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1858  hypothetical protein  25.88 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  28.07 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  32.95 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0926  (3R)-hydroxymyristoyl-acyl-carrier-protein dehydratase, putative  27.74 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  27.17 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3306  hypothetical protein  29.9 
 
 		 168 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  27.47 
 
 		 169 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>