25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3925 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3925  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.925747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  66.67 
 
 		 169 aa  173  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2768  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  64.62 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2154  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  64.62 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  62.1 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  61.29 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6098  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  62.31 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3306  hypothetical protein  57.89 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1369  hypothetical protein  59.54 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000549037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  54.76 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2687  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  57.04 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2820  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  56.3 
 
 		 177 aa  137  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0937  hypothetical protein  56.39 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.959772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0794  hypothetical protein  56.39 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0926  (3R)-hydroxymyristoyl-acyl-carrier-protein dehydratase, putative  55.56 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  52.42 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1326  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  50.79 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0256156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2677  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  50.79 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0252517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2755  hypothetical protein  59.68 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  48.8 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3986  hypothetical protein  46.15 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03729  xanthomonadin biosynthesis phosphotransferase/dehydratase  38.58 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1986  xanthomonadin biosynthesis protein  40.32 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2064  phosphotransferase  39.52 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  39.19 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>