32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2755 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2755  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  65.25 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2768  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  62.14 
 
 		 167 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2154  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  62.14 
 
 		 167 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  60.71 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3306  hypothetical protein  58.71 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2687  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  60 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6098  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  59.44 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2820  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  58.62 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  57.86 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  57.86 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2677  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  56.76 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0252517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3986  hypothetical protein  53.96 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849998  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1369  hypothetical protein  58.82 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000549037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0794  hypothetical protein  54.79 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0937  hypothetical protein  54.79 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.959772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1326  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  51.61 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0256156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0926  (3R)-hydroxymyristoyl-acyl-carrier-protein dehydratase, putative  55.24 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3925  hypothetical protein  59.68 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.925747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03729  xanthomonadin biosynthesis phosphotransferase/dehydratase  42.54 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1986  xanthomonadin biosynthesis protein  42.31 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2064  phosphotransferase  40.77 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  42.22 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  42.22 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  42.35 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  38.67 
 
 		 151 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  34.15 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>