59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3392 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  65.43 
 
 		 162 aa  216  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.32 
 
 		 167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  69.59 
 
 		 163 aa  214  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  66.45 
 
 		 197 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  66.01 
 
 		 158 aa  197  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  60 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  60 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  59.38 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  55.15 
 
 		 178 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  55.15 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  55.15 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  58.39 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  55.76 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  52.73 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  38.69 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  39.73 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  36.57 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  38.3 
 
 		 151 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  34 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  36.3 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  35.71 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  36.49 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  36.55 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  33.11 
 
 		 158 aa  87.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  35.97 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.04 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.38 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.17 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.38 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.17 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.63 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.63 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  32.45 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  32.84 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  30.67 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.72 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 497 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  27.27 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0613  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.09 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000688375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1283  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.6 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  30.49 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0351  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  33.85 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2353  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  34.85 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0023817  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0125  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.38 
 
 		 137 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00813432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3970  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.91 
 
 		 167 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00469939  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_002950  PG0071  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  31.82 
 
 		 462 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0127  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.38 
 
 		 137 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00201023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2576  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  34.72 
 
 		 446 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0363046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3779  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  34.67 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301111  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1291  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  30.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0436  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.86 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3748  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  31.08 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1850  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  35.62 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2765  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.37 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0545  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.87 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.333587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>