58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4381 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  94.38 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  94.38 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  93.82 
 
 		 179 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  80.75 
 
 		 178 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  80.12 
 
 		 177 aa  267  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  80.12 
 
 		 178 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  78.88 
 
 		 178 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  77.91 
 
 		 177 aa  261  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  63.74 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  64.78 
 
 		 167 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  61.64 
 
 		 162 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  59.52 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  58.39 
 
 		 167 aa  184  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  62.66 
 
 		 158 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  41.56 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  31.68 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  31.06 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  31.41 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  30.19 
 
 		 152 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  38.93 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  30.61 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  31.37 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.68 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  29.22 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.52 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.52 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  31.68 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  30.14 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  30.07 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.14 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.45 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.76 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.76 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.35 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 147 aa  62  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  26.71 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  25.5 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.16 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1994  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0666  cylZ protein  28.35 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  34.52 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03890  hypothetical protein  27.47 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2949  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  26.83 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00111585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2330  thioester dehydratase family, FabZ subfamily  29.91 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707055  hitchhiker  0.0000246519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2628  3-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  28.32 
 
 		 132 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2917  thioester dehydratase family protein, FabZ subfamily  28.95 
 
 		 132 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3970  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  31.43 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00469939  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0823  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, putative  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3258  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.72 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 497 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1353  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.79 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.315104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0819  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.121234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2706  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.83 
 
 		 132 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2630  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  32.47 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2651  3-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  26.23 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000771574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2939  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, putative  27.03 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000846651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>