33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1994 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1994  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1858  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2120  hypothetical protein  39.23 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0692944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03890  hypothetical protein  35.07 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1101  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0546  hypothetical protein  34.31 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.460659  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0545  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.37 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.333587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1100  hypothetical protein  34.62 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  31.53 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  32.43 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  30.63 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  32.43 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  29.46 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 497 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  31.17 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2659  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase  26.72 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  27.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.2 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  27.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  28.57 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3437  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0823  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, putative  31.78 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  30.38 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1697  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, putative  25.83 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  27.69 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3604  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  24.44 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1400  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  21.17 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2191  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  23.93 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5140  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  24.26 
 
 		 153 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.0209329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4675  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  24.26 
 
 		 153 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.267038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  29.87 
 
 		 151 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.56 
 
 		 152 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>