35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03890 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03890  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  296  7e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0546  hypothetical protein  51.08 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.460659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1101  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1858  hypothetical protein  39.39 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1994  hypothetical protein  35.07 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2120  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0692944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0545  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.06 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.333587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1100  hypothetical protein  39.06 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  35.37 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  26.81 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  26.83 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.11 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  30.11 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  30.11 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08166  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  28.48 
 
 		 467 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  28.74 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2903  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  28.67 
 
 		 465 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0619289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  28.74 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  23.08 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  25.58 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  25.86 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  24.16 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  27.47 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.36 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  28.44 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1918  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  23.49 
 
 		 438 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000565023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  21.71 
 
 		 197 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2265  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.9 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0969  3-hydroxydecanoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  34.38 
 
 		 140 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.015297  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1853  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  22.3 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.496343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1457  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  23.4 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  25.61 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1326  potential 3-hydroxydecyl-(acyl carrier protein) dehydratase  24.73 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0256156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0796  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  31.21 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.692022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>