59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4580 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 160 aa  332  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  56.86 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  51.55 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  48.39 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  34 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  34.72 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  35.53 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  34.51 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  34.51 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  34.53 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.88 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  32.61 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  28.48 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  33.57 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  27.92 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.05 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.05 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  28.3 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.16 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  28.77 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  27.92 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  30.72 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  27.92 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  27.92 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.92 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.7 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.46 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  25.32 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  25.16 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  25.17 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1545  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.79 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  25.17 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  24.5 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.57 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  23.23 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  25.52 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0351  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.14 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1354  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.37 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.552396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1157  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.07 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4175  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.07 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1112  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.08 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.498741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0436  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.34 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000377622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1602  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.07 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4071  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.67 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  27.69 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38880  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.37 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1950  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  31.51 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0425  hypothetical protein  36.36 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.534973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 497 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2576  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  23.18 
 
 		 446 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0363046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1371  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.93 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727099  normal  0.010855 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2712  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.93 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>