55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3609 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  100 
 
 		 167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  62.59 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  55.09 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  57.82 
 
 		 160 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  56.21 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  55.1 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  55.1 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  41.22 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  31.29 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  39.44 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  34.53 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  29.87 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  29.87 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  33.79 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  33.81 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.76 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  29.94 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  30.97 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  30.52 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  29.87 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  29.87 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.87 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  30.63 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  29.87 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.34 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.03 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  30.37 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.33 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.04 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.45 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.14 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  27.14 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.05 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  28.28 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  27.74 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  32.37 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0473  hypothetical protein  32.79 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4187  hypothetical protein  31.71 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.443262 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1443  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.95 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1918  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  22.73 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000565023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29800  3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  29.71 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0069  hypothetical protein  33.91 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0937  hypothetical protein  40.91 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.959772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0794  hypothetical protein  40.91 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0313  hypothetical protein  36.54 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2625  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.47 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000137292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1847  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.27 
 
 		 148 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000663775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0301  hypothetical protein  37.35 
 
 		 153 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  26.55 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2154  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like  36.99 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2768  3-hydroxylacyl-(acyl carrier protein) dehydratase-like protein  36.99 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>