46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003859 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003859  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01820  hypothetical protein  74.14 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0642  hypothetical protein  50.65 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1485  hypothetical protein  39.74 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  39.46 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  34.21 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  33.55 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1325  hypothetical protein  37.33 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  33.55 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3377  hypothetical protein  34.15 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1172  hypothetical protein  32.45 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000985438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  32.45 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  32.45 
 
 		 190 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3029  hypothetical protein  37.67 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1373  hypothetical protein  30.92 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0818  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2770  hypothetical protein  34.69 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179795  normal  0.403959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  34.75 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  32.92 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1486  hypothetical protein  31.72 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  41.59 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  30.82 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  29.76 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  29.56 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  30.67 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  28.22 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03342  hypothetical protein  27.52 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6099  hypothetical protein  27.5 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0186917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0493  hypothetical protein  29.38 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.447008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  27.38 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  27.38 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0233  hypothetical protein  24.07 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  24.57 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1056  hypothetical protein  26.75 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  27.63 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  26.14 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  23.17 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  26.95 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  24.67 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  26.83 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0411  hypothetical protein  27.03 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0231589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  27.92 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>