More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003618 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003618  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  969    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  54.89 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1229  sensor histidine kinase  45.61 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.131746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  31.88 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  31.76 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  29.52 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  31.15 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 454 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  27.89 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  31.52 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  29.2 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  31.3 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  31.3 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  30.87 
 
 		 449 aa  183  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  30.87 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  30.87 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  30.87 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  30.87 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  29.41 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  30.87 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  28.04 
 
 		 476 aa  181  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  32.18 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.9 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  27.33 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  28.88 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  30.25 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  28.4 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  30.25 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  30.23 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 501 aa  170  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02325  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280945  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 515 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  33.45 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  30.08 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  33.14 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  29.01 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  33.91 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.04 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.19 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  29.87 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.6 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 505 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 505 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  29.3 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  25.28 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.29 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>